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Illumina 测序技术的准确性,实现转录组和靶向重测序应用

放大字体  缩小字体 发布日期:2020-06-16  浏览次数:0
核心提示:源自成熟的Illumina新一代测序(NGS)系统配资 组合,经创新改良的NextSeq550测序系统可同时提供高通量测序和芯片扫

   源自成熟的Illumina新一代测序(NGS)系统配资 组合,经创新改良的NextSeq550测序系统可同时提供高通量测序和芯片扫描能力,以及台式测序仪的操作便捷性(图1)。具备快速、一体化、从DNA初始材料至数据生成的工作流程,可以在一次运行中快速实现外显子组、靶向panel和转录组测序,同时还具有根据需要转换为较低通量测序的灵活性。集成式测序与芯片扫描系统,无缝适应多种研究实验室,减少对多种仪器的需求。Illumina的科学家全程提供支持,让研究人员可以专注于获得突破性的发现。

    NextSeq550系统帮助研究人员紧跟技术的发展,并将新技术应用于测序和芯片项目中。本系统强大并可扩展,能让各类高通量应用变为价格可承受的日常研究工具。NextSeq550系统的灵活性可帮助研究人员快速地在不同的应用之间切换,并且根据样本量和覆盖度需求调整产出的数据量。如今,即使是最小的实验室都能够使用各类新一代测序和芯片应用来推进他们的研究并加速实现研究目标。

    NextSeq550测序系统能针对不同的项目规模和测序通量提供适合的测序仪,为用户提供优化的操作效率。NextSeq550系统同样可以在一天的周转时间内实现一系列热门的测序应用。使用本款仪器,研究人员可以在每次运行时对一系列样本进行测序:

    1–12个外显子组

    1–16个转录组

    6–96个靶向panel

    12–40个基因表达图谱样本

    NextSeq550系统配置便捷,并为研究人员提供可扩展性,以处理从低通量到高通量的项目规模。基于样本量和覆盖度的需求,研究人员可以在两种不同的流动槽模式(高产出和中等产出)中进行选择,方便每次测序运行时在较低与较高通量之间切换。NextSeq550系统为双端测序提供集成式支持,提供长至2×150bp的用户可定义测序read长度。系统支持全系列Illumina文库制备和靶向富集解决方案,测序文库可与Illumina其他的测序平台兼容。这可以帮助研究人员方便地将研究升级至更高通量的HiSeq和NovaSeq系列系统,或是使用MiSeq系列系统进行后续的研究。

    NextSeq550测序系统提供多个数据分析选项。与仪器集成的计算机执行碱基检出和质量评分。测序运行数据可通过专为Illumina数据开发的一系列开源或商用途径进行分析,或即刻被转移、分析、并安全存储在Illumina的BaseSpaceSequenceHub等基因组计算环境中。BaseSpaceSequenceHub分析应用程序包括比对和变异体检出、注释、可视化和判读。BaseSpaceSequenceHub还包括可用于外显子组、转录组、全基因组,以及体细胞变异检出的数据分析应用程序。得益于行业标准的数据格式,第三方开发人员创建了一个丰富的生态系统,包括商用工具和开源工具,用于更为广泛的下游数据分析。

    参考文献:NextSeq550测序系统

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